• Programa de lenguaje en Kinder.
• Método de lecto-escritura inicial Matte, aplicado en 1° básico.
• Programa de lenguaje de 2° a 4° básico aplicado a partir desde año 2006. 
• También, puede acceder al Programa de lenguaje de 2° a 8° básico anterior, aplicado hasta el año 2005.
• Programa de lenguaje de Iº a IVº medio.
• Programa de motivación de la lectura "Yo amo leer"
• Evaluaciones sistemáticas desde la Dirección: La Fundación Astoreca considera que la evaluación es parte fundamental del proceso de aprendizaje. Por eso evalúa constantemente los avances, poniendo especial énfasis en las evaluaciones del área de lenguaje.
  • Evaluación de lectura - lecciones Método de lecto-escritura inicial Matte para 1° básico.
  • Medición de la velocidad lectora de 1° a 8° básico.
  • Evaluación de la comprensión lectora de 2° a 8° básico.
  • Evaluación de la comprensión lectora de I° a IV° medio.
  • Evaluación de la motivación por la lectura de 2° a 8° básico.

Matemáticas
Se ha confirmado que los niños de sectores de escasos recursos, adquieren los conocimientos lógico-matemático en forma mecánica, sin comprensión, lo que les resta la posibilidad de utilizarlos en la resolución de problemas concretos. Para remediar este problema, el colegio San Joaquín ha implementado los siguientes programas y evaluaciones:

• Programa de Matemáticas Kinder, basado en el programa de Mary Baratta Lorton: diseñado en E.E.U.U. para niños de minorías étnicas que presentaban dificultades en el manejo y utilización de los conceptos matemáticos. Este programa se aplica en Kinder y se utilizan sus orientaciones en los otros cursos.
• Programa de Matemáticas 1º básico: El programa de matemáticas de la Fundación Astoreca se inició en el año 2009, como plan piloto en los colegios San Joaquín de Renca y San José de Lampa. El programa se encuentra alineado con los ajustes curriculares del Ministerio de Educación y se distribuye en 18 unidades durante el año. 
• Programa de Matemáticas - Scott Foresman: en los ciclo básicos se utilizan los textos "Explora las Matemáticas", desarrollados por la Editorial Scott Foressman. Su enfoque es construir el pensamiento lógico matemático necesario para aplicar lo aprendido a la vida diaria. Las librería SBS y Galileo, entre otras distribuyen éstos libros.
• Programa de Matemáticas Aplicada: aplicado en Enseñanza Media. El programa fue desarrollado por la Fundación CORD, consorcio educativo de Waco-Texas, financiado por el Banco Mundial, e implementado en Chile por el Centro de Investigación y Desarrollo, CIDE. Este programa persigue que los alumnos adquieran un manejo instrumental de las matemáticas, orientándose a la resolución de problemas en base a las nuevas tecnologías, a la creatividad y al trabajo en equipo. Más información en "Programa Mentes Activas" de la páginda del CIDE.
• Evaluaciones sistemáticas desde Dirección:
  • Evaluación de combinaciones básicas de sumas - restas y multiplicaciones - divisiones  
  • Evaluaciones desde Dirección para Kinder a 8° básico 

La Fundación Astoreca organizó los objetivos y contenidos mínimos del área de matemáticas propuestos por el Ministerio de Educación. Los listados que se entregan conforman la Red de contenidos de 1° a 8° básico y corresponden al curriculum anterior al año 2008, propuesto por el Ministerio. Actualmente, estos listados están siendo modificados para hacerles las adaptaciones correspondientes a los cambios de curriculum.

Historia y Geografía
Para compensar la deficiencia cultural existente en las familias de nuestros alumnos, se desarrolló un programa de Historia y Geografía que estimula a los niños desde temprana edad con un currículum rico en contenido. Este programa se ve apoyado con la teoría de E.D. Hirsch, de la Fundación norteamericana Core Knowledge, quien asigna una importancia fundamental a que el colegio provea a los niños de una base cultural amplia para lograr una educación más igualitaria.

• Programa, contenidos, planificaciones y calendarizaciones, Cuadernos y pruebas de Historia y Geografía, clasificados por curso
• Mapas mudos
• Evaluación de geografía universal desde Dirección

Programa de Ciencias
El programa de Comprensión del Medio Natural fue aplicado hasta el año 2008 en toda la Enseñanza Básica. Éste fue preparado por Constanza Jory, quien realizó una selección de contenidos a partir del curriculum ministerial y capacitó a las profesoras para su implementación durante un curso de perfeccionamiento realizado a lo largo del año 2001.
A partir del año 2009, desde 5º a 8º básico se implementó el programa porpuesto por el Ministerio de Educación.

Junto con esto, a partir de 5° Básico, en el Colegio San Joaquín se desarrollan una serie de talleres que aplican una pedagogía remedial para asegurar la comprensión de los conceptos básicos en esta materia. El currículum y la metodología son desarrollados y supervisados por CREA. (Centro de Recursos Educativos Avanzados)

Programa de Formación complementaria
Como formación complementaria para el trabajo, se introdujo a partir de 1996, el
Taller de INACAP para la Enseñanza Media, correspondiente a 4 horas pedagógicas (45 minutos) semanales.

Taller de Computación
Los niños del Colegio San Joaquín reciben semanalmente una hora de clases de computación en Enseñanza Básica. En Enseñanza Media, este período aumenta a 2 horas semanales. El programa es apoyado y controlado por el Centro de Extensión de la Pontificia Universidad Católica de Chile.
El colegio cuenta con un laboratorio con 30 computadores, cuatro computadores en la sala de biblioteca y tres en la sala de profesores. Se contrató para dirigir y mantener el laboratorio a un profesor especializado con jornada completa. En recreos y las tardes los alumnos tienen libre acceso a los computadores.
Los alumnos que aprueben los exámenes finales, egresan de Enseñanza Media con un título de usuario en computación acreditado por el Centro de Extensión de la Pontificia Universidad Católica de Chile.

Programa de Religión
Se imparten clases de Religión en cada uno de los cursos, donde se enseña a los niños la doctrina de la Iglesia Católica.
Semanalmente se realiza una Misa en el Colegio dirigida a toda la comunidad. En forma regular se prepara a los niños para la "Primera Comunión". Todos los días se reza el Rosario con quienes quieran hacerlo como actividad voluntaria.
No obstantelo anterior, el ingreso y la permanencia en el Colegio no se condicionan a la religión que practiquen los alumnos.